DeepInter

华科大团队开发几何三角形感知蛋白质语言模型,预测蛋白质-蛋白质接触

编辑 | 萝卜皮有关相互作用蛋白质之间的残基-残基距离的信息对于蛋白质复合物的结构建模非常重要,并且对于理解蛋白质-蛋白质相互作用的分子机制也很有价值。随着深度学习的出现,人们开发了许多方法来准确预测单体的蛋白质内残基-残基接触。然而,准确预测蛋白质复合物,尤其是异源蛋白质复合物的蛋白质间残基-残基接触仍然具有挑战性。华中科技大学的研究人员开发了一种基于蛋白质语言模型的深度学习方法,通过在深度神经网络中引入三角形更新和三角形自注意力的三角形感知机制来预测蛋白质复合物的蛋白质间残基-残基接触(称为 DeepInter
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