先导

一个半月内加速药物设计,浙大侯廷军团队提出深度先导化合物优化AI新方法

编辑 | 萝卜皮通过系统性改造来优化有前途的候选药物的化学结构,以提高药效和物理化学性质,这是药物发现过程中至关重要的一步。 与成熟的从头生成方案相比,专门针对先导化合物优化的计算方法仍未得到充分探索。 先前的模型通常仅限于解决特定的子任务,例如生成二维分子结构,而忽略了三维空间中至关重要的蛋白质-配体相互作用。

优于SOTA,腾讯AI Lab开发双重扩散模型,实现靶标配体3D分子生成和先导化合物优化

编辑 | 萝卜皮基于结构的生成化学,通过探索广阔的化学空间来设计对靶标具有高结合亲和力的配体,在计算机辅助药物发现中至关重要。然而,传统的计算机方法受到计算效率低下的限制,机器学习方法则因自回归采样而面临瓶颈。为了解决这些问题,腾讯 AI lab、香港城市大学、锐格医药(Regor Therapeutics Group)的研究人员开发了一种条件深度生成模型 PMDM,用于生成适合特定靶标的 3D 分子。PMDM 由具有局部和全局分子动力学的条件等变扩散模型组成,使 PMDM 能够考虑条件蛋白质信息从而有效地生成分子
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