压缩率达10的48次方,实现蛋白序列空间极端压缩,清华EvoAI登Nature子刊
编辑 | 萝卜皮设计功能更佳的蛋白质需要深入了解序列和功能之间的关系,这是一个难以探索的广阔空间。 通过识别功能上重要的特征来有效压缩这一空间的能力极其宝贵。 清华大学的研究团队建立了一种称为 EvoScan 的方法,用于全面分割和扫描高适应度序列空间,以获得能够捕捉其基本特征(尤其是在高维度中)的锚点。- 973
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探索蛋白质动态变化,新AI方法JAMUN比标准MD模拟更快、更准确
编辑 | 白菜叶蛋白质结构的动态变化对于理解其功能和开发靶向药物治疗至关重要,尤其是对于隐蔽的结合位点。 然而,现有的生成构象集合的方法存在效率低下或缺乏通用性的问题,无法在训练系统之外发挥作用。 分子动力学 (MD) 模拟是当前探索蛋白质运动的标准,但计算成本高昂,且受短时间步长要求的限制,因此难以捕捉较长时间尺度上发生的更广泛蛋白质构象变化。- 974
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准确、高效、物理有效,中科大、北大提出「两段式」分子对接统一框架DeltaDock
编辑 | KX分子对接是一种预测配体结合姿势的技术,在基于结构的药物设计中对于理解蛋白质-配体相互作用至关重要。 最近,几何深度学习 (GDL) 对接方法,比传统采样方法具有更高的效率和准确性。 然而,当前的方法通常是针对特定的对接设置量身定制的,并且会忽略蛋白质侧链结构,难以处理大型结合口袋,难以预测物理有效结构。- 11
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BioBit Program启动!之江实验室携手全球顶级钻研团队开展生物较量争论国内迷信单干
11 月 5 日,之江实验室主办的首届生物较量争论国内学术会议在实验室南湖总部成功举行。会上,之江实验室发起并正式启动生物较量争论国内单干迷信计划(BioBit Program),携手伦敦大学、华盛顿大学、以色列理工学院等国内顶尖科研力量,共同开展生物较量争论创新试探钻研,赋能生命健康、新材料、环境等多范围成长。“BioBit Program 为生物较量争论这一新兴范围建立了一个跨越边界的科研交流…- 12
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直播预约 | “BT + IT ”,这场论坛邀您共论生物算计家当发展新范式
9 月 2 日 13:00,2022 上海生物算计论坛,精彩相约!随着 AI 生物学算计应用的逐渐广泛,生物算计已经成为人工智能发展的下一个明珠。依托上海强大的生物医药和人工智能家当基础,在世界人工智能大会组委会办公室指导下,由上海市生物医药家当促进中心、上海市人工智能行业协会、呆板之心发起并联合主办,上海中青年知识份子联谊会、上海市经济和信息化系统中青年知识份子联谊会协办 2022 上海生物算计…- 7
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生物技术初创Lumen与google合作,用机械进修让螺旋藻蛋白出产力翻倍
编辑/凯霞机械进修可以促进鉴于藻类的生物制剂出产吗?8 月 11 日,西雅图生物技术初创公司 Lumen Bioscience (以下简称「Lumen」)与google宣布合作,将利用机械进修来推进鉴于螺旋藻(一种蓝绿藻)的药物开发。Lumen 表示,该钻研由 Lumen 的信息学负责人 Caitlin Gamble 和google加速科学工程师 Drew Bryant 领导。Lumen 联合创始…- 36
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