提速1400倍,准确标注酶活性位点,浙大、澳门理工多模态深度学习方法,登Nature子刊
编辑 | 萝卜皮注释酶中的活性位点对于药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展至关重要。尽管已经开发出许多自动注释算法,但速度和准确性之间的重大权衡限制了它们的大规模实际应用。浙江大学、澳门理工大学等机构的联合研究团队引入了 EasIFA,一种酶活性位点注释算法,它融合了来自蛋白质语言模型和 3D 结构编码器的潜在酶表示,然后使用多模态交叉注意框架将蛋白质水平信息与酶促反应知识对齐。…- 6
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比传统格式高30倍,中国科学院团队Transformer深度学习模型展望糖-卵白质作用位点
编辑 | 萝卜皮糖类是自然界中最丰富的有机物质,对生命至关重要。了解糖类如何在生理和病理过程中调节卵白质,可以为解决关键的生物学问题和开发新的治疗格式提供机遇。然而,糖类份子的多样性和复杂性,对实验鉴别糖-卵白质连系以及相互作用的位点提出了挑战。在这里,中国科学院团队开发了一种深度学习模型 DeepGlycanSite,它能够准确展望给定卵白质构造上的糖连系位点。DeepGlycanSite 将卵…- 3
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