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从概念到应用，清华团队开发DeepTFBU工具包助力基因表达精准调控

编辑 | 萝卜皮增强子通过与转录因子 (TF) 相互作用，在各种生物过程中充当基因表达的关键调节器。虽然转录因子结合位点 (TFBS) 被广泛认为是 TF 结合和增强子活性的关键决定因素，但其周围背景序列的重要作用仍有待定量表征。清华大学的研究团队提出了转录因子结合单元（transcription factor binding unit，TFBU）概念，通过使用深度学习模型量化 TFBS 周围上下文序列的影响，模块化地建模增强子。

预测精度媲美实验！哥大团队开发可解释细胞「基础」模型，揭示213种人类细胞调控语法

编辑 | 萝卜皮转录调控涉及调控序列和蛋白质之间的复杂相互作用，指导所有生物过程。转录计算模型缺乏通用性，无法准确推断未知的细胞类型和条件。哥伦比亚大学的研究人员介绍了 GET（general expression transformer），这是一种可解释的基础模型，旨在揭示 213 种人类胎儿和成人细胞类型的调控语法。

TensorFlow 2.8.0正式上线，修复众多Bug，发布50多个漏洞补丁

TensorFlow 2.8.0 来了。