Pianno

新SOTA,仅几个标记基因即可自动标记,复旦大学开发空间转录组学语义注释贝叶斯框架

编辑 | 萝卜皮空间转录组学的出现,彻底改变了组织内基因表达的研究。然而,注释空间点的生物特性仍然是一个挑战。为了解决这个问题,复旦大学的研究人员引入了 Pianno,一个基于标记基因自动进行结构语义注释的贝叶斯框架。Pianno 在精确注释各种空间语义(从不同的解剖结构到复杂的肿瘤微环境)以及估计细胞类型分布(跨各种空间转录组学平台生成的数据)方面的卓越能力。研究人员使用 Pianno 结合聚类方法,揭示了人类新皮质深层 3 中区域和物种特异性的兴奋性神经元亚型,展示了人类新皮质的细胞进化过程。Pianno 作为
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