PepFlow

Nature子刊,优于AlphaFold,全原子采样,一种预测肽结构的AI方法

编辑 | 萝卜皮深度学习方法推动了生物分子结构单态预测的重大进展。然而,生物分子的功能取决于它们可以呈现的构象范围。对于肽来说尤其如此,肽是一类高度灵活的分子,参与多种生物过程,作为治疗手段备受关注。多伦多大学的 Philip M. Kim 和 Osama Abdin 开发了 PepFlow,这是一种可转移生成模型,它能够从输入肽的允许构象空间中直接进行全原子采样。研究人员在扩散框架中训练模型,然后使用等效流进行构象采样。为了克服广义全原子建模的成本过高,他们模块化了生成过程并集成了超网络来预测序列特定的网络参数。
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