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加速精准医疗,开源GNN实现分子精准建模,质谱识别准确率提升至49%

编辑丨&非靶向代谢组学在推进精准医学和生物标志物发现方面前景广阔。 由于谱图参比库的不完整,从串联质谱中鉴定化合物在当前仍是一项颇有挑战的任务。 为了应对这项挑战,德国联邦材料研究与测试研究所(BAM)与柏林自由大学的一支团队提出了 FIORA,这是一种旨在模拟串联质谱的开源图神经网络。
3/12/2025 12:03:00 PM
ScienceAI

糖蛋白组学新方法,复旦开发基于Transformer和GNN的混合端到端框架,登Nature子刊

编辑 | 萝卜皮蛋白质糖基化是糖基对蛋白质进行的一种翻译后修饰,在细胞的多种生理和病理功能中起着重要作用。糖蛋白质组学是在蛋白质组范围内研究蛋白质糖基化,利用液相色谱与串联质谱 (MS/MS) 联用技术获取糖基化位点、糖基化水平和糖结构的组合信息。然而,由于结构决定离子的出现有限,目前糖蛋白质组学的数据库搜索方法通常难以确定聚糖结构。虽然光谱搜索方法可以利用碎片强度来促进糖肽的结构鉴定,但是光谱库构建的困难阻碍了它们的应用。在最新的研究中,复旦大学的研究人员提出了 DeepGP,一种基于 Transformer 和
8/4/2024 7:57:00 PM
ScienceAI

ChatGPT复古玩法:39年前老电脑+DOS系统也能玩转

当 ChatGPT 遇到 MS-DOS 系统,你可以会有一种穿越的感觉。
3/28/2023 7:58:00 PM
机器之心

Triton推理服务器在阿里云机器学习PAI-EAS公测啦!!!

引言近些年来,随着GPU等计算设备算力的飞速提升,对算力要求较高的深度学习模型逐步开始在网购、医疗、音视频领域有了越来越广泛的应用。如何结合深度学习框架,用好高算力的GPU设备,是我们在AI基础建设中遇到的一个至关重要的问题。英伟达公司从硬件厂商的角度出发推出了Trition推理服务器,阿里云PAI平台从云原生服务角度出发,推出了PAI-EAS云原生弹性推理服务平台,目的都是为了更好地帮助用户更好更方便地部署深度学习,提供优质的在线预测服务。首先我们来了解一下Triton和EAS具体是什么,以及我们为什么要将两者进
7/20/2021 11:01:00 AM
阿里云大数据AI技术
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