ESM3
蛋白质设计新纪元：语言模型驱动的 5 亿年进化模拟
在生命科学的浩瀚星空中，蛋白质一直是最为璀璨的研究焦点之一。 近期，一项由 Thomas Hayes 等众多学者共同完成的研究成果 —— 利用语言模型模拟 5 亿年蛋白质进化，在《Science》杂志重磅发表，如同一颗超新星爆发，瞬间照亮了整个领域，为蛋白质研究开启了全新的篇章。 一、ESM3 模型架构揭秘ESM3 模型作为此项研究的核心成果，无疑是一座闪耀着创新光芒的科学丰碑。
模拟5亿年的进化信息，首个同时推理蛋白质序列、结构和功能的生物学大模型
编辑 | 萝卜皮在三十亿年的自然进化历程中，现存蛋白质的形态得以形成，经历了漫长的自然筛选过程。进化如同在地质时间尺度上进行的平行实验，通过随机突变和选择机制，依据蛋白质的序列、结构与功能进行筛选。在这里，EvolutionaryScale 的研究人员展示了在进化产生的标记上训练的语言模型可以充当进化模拟器，用于生成不同于已知蛋白质序列的功能性蛋白质。研究人员提出了 ESM3，这是一种前沿的多模态生成语言模型，可推理蛋白质的序列、结构和功能。ESM3 可以结合其模态来遵循复杂的提示，并且对生物学对齐（biologi
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