EasIFA

提速1400倍,准确标注酶活性位点,浙大、澳门理工多模态深度学习方法,登Nature子刊

编辑 | 萝卜皮注释酶中的活性位点对于药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展至关重要。尽管已经开发出许多自动注释算法,但速度和准确性之间的重大权衡限制了它们的大规模实际应用。浙江大学、澳门理工大学等机构的联合研究团队引入了 EasIFA,一种酶活性位点注释算法,它融合了来自蛋白质语言模型和 3D 结构编码器的潜在酶表示,然后使用多模态交叉注意框架将蛋白质水平信息与酶促反应知识对齐。EasIFA 比 BLASTp 速度提升 10 倍,召回率、准确率、f1 分数和 MCC 分别提升 7.57%、13.0
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