蛋白质语言模型

AI做生物实验？还能迭代？浙大集成PLM和「自动化生物工厂」革新蛋白质工程范式

编辑 | 萝卜皮传统的蛋白质工程方法（如定向进化）虽然有效，但通常速度缓慢且劳动密集。机器学习和「自动化生物工厂」的进步为优化这些过程提供了新的机会。浙江大学的研究人员设计了一个基于蛋白质语言模型的自动进化平台，这是一个在设计-构建-测试-学习循环内实现蛋白质工程自动化的闭环系统。

首次，西湖大学用蛋白质语言模型定向改造碱基编辑器，登Cell子刊

编辑 | ScienceAI在基因组编辑领域，单碱基编辑器通过将可编程的DNA结合蛋白与碱基修饰酶融合，实现在不引起DNA双链断裂的情况下，对基因组中特定碱基进行精确修改。尽管依赖于胞嘧啶（C）碱基编辑器（CBE）或腺嘌呤（A）碱基编辑器（ABE）介导的脱氨反应，这些编辑器能够实现C到胸腺嘧啶（T）或A到鸟嘌呤（G）的突变，但它们在诱导所有类型的点突变，尤其是颠换突变方面仍存在局限性。近期，西湖大学团队在《Molecular Cell》上发表了一篇题为「Protein language models-assiste