ColabDock

Nature子刊,北大团队通用AI框架对蛋白-蛋白对接进行综合结构预测,弥合实验与计算的差距

编辑 | 萝卜皮蛋白质复合物结构预测在药物研发、抗体设计等应用中发挥着重要作用,然而由于预测精度有限,预测结果与实验结果经常出现不一致。北京大学、昌平实验室以及哈佛大学的研究团队提出了 ColabDock,这是一个通用框架,它采用深度学习结构预测模型来整合不同形式和来源的实验约束,而无需进一步进行大规模的再训练或微调。ColabDock 的表现优于使用 AlphaFold2 作为结构预测模型的 HADDOCK 和 ClusPro,不止在具有模拟残基和表面限制的复杂结构预测中,在借助核磁共振化学位移扰动以及共价标记进
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