CCI

哈工大&南医大开发深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞间相互作用

编辑 | 萝卜皮细胞间相互作用(CCIs)在细胞分化、组织稳态和免疫反应等许多生物过程中发挥着关键作用。随着高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的快速发展,从不断增加的 scRNA-seq 数据中识别CCIs变得非常重要。然而,受算法限制,当前基于统计策略的计算方法忽略了高度稀疏性和异质性的 scRNA-seq 数据中包含的一些关键潜在信息。哈尔滨工业大学和南方医科大学的研究团队开发了一个名为 DeepCCI 的深度学习框架,用于从 scRNA-seq 数据中识别有意义的 CCI。在灵活且易于使用的软件

哈工大开发深度学习框架,用于从单细胞RNA测序识别细胞相互作用

编辑 | 萝卜皮细胞间相互作用(CCIs)在细胞分化、组织稳态和免疫反应等许多生物过程中发挥着关键作用。随着高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的快速发展,从不断增加的 scRNA-seq 数据中识别CCIs变得非常重要。然而,受算法限制,当前基于统计策略的计算方法忽略了高度稀疏性和异质性的 scRNA-seq 数据中包含的一些关键潜在信息。哈尔滨工业大学和南方医科大学的研究团队开发了一个名为 DeepCCI 的深度学习框架,用于从 scRNA-seq 数据中识别有意义的 CCI。在灵活且易于使用的软件
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