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Protein BLAST会成为过去吗？AlphaFold等对蛋白结构的搜索是否会取代对序列的搜索

编辑 | 白菜叶像 AlphaFold 这样的蛋白质结构搜索工具会用 BLAST 取代蛋白质序列搜索吗？德累斯顿工业大学的研究团队讨论了使用结构搜索进行远程同源性检测的前景，以及为什么蛋白质 BLAST 作为领先的序列搜索工具应努力纳入结构信息。BLAST 广泛用于分子生物学中搜索核苷酸和蛋白质序列。BLAST 推出三十年后，结构预测出现了重大突破，出现了 RoseTTAFold 和 AlphaFold 等工具。因此，主要序列数据库中的每个蛋白质序列现在都带有一个 3D 折叠模型。虽然这不会影响（非编码）核苷酸序列