RNA 3D 结构预测

南开&山大&北理工团队开发trRosettaRNA：利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构

编辑 | 萝卜皮RNA 3D 结构预测是一个长期存在的挑战。受最近蛋白质结构预测领域突破的启发，南开大学、山东大学以及北京理工大学的研究团队开发了 trRosettaRNA，这是一种基于深度学习的自动化 RNA 3D 结构预测方法。trRosettaRNA 流程包括两个主要步骤：通过transformer网络进行 1D 和 2D 几何形状预测；以及通过能量最小化进行的 3D 结构折叠。基准测试表明 trRosettaRNA 优于传统的自动化方法。在 CASP15 和 RNA-Puzzles 实验的盲测中，对天然 R