DNA

Is DNA all you need？ AI可以实现从分子到基因组尺度的预测和生成任务了！ 图片就在刚刚，这项研究登上了Science封面。

编辑 | X_XChatGPT 可以写小说、编写计算机代码、给出食谱，它的硅片上包含了互联网上的大部分信息。 如果它能对 DNA 做同样的事情会怎么样？ 今天，刊登在《Science》封面上一项最新研究，美国 Arc 研究所（Arc Institute）和斯坦福大学的研究团队提出了一种机器学习模型「Evo」，其能够以无与伦比的准确性解码和设计从分子到基因组规模的 DNA、RNA 和蛋白质序列。

棉花产量与纤维品质如何受到DNA甲基化调控？ 在AI的帮助下，中国棉花育种专家成功破译这一“密码本”，并从中找出有望改良棉花品种的关键基因位点。 近日，由浙江大学棉花精准育种团队、中国农科院生物技术所和湖畔实验室（阿里巴巴达摩院）智慧育种团队组成的联合科研团队，综合运用遗传学、生物大数据和AI技术，构建了涵盖207个品种的棉花全基因组DNA甲基化图谱，鉴定2.87亿个单甲基化多态性（SMP）位点，…

编辑 | 萝卜皮不久之前，Google DeepMind 发布了 AlphaFold3，再次引发了人们对「AI 生命科学」的讨论。在学界，科学家的目标往往是先认识世界，然后在认识的前提上改造世界。但是在生命科学领域，人类对整个生命的理解与认识还如九牛一毛、冰山一角；建立对生命体系的多维度深刻认识是当前人类研讨的重要一步，AI 是达成这一步的重要工具。近期，阿里云飞天实验室发布并开源了业界首个联合 …

编辑 | 萝卜皮基因组是完整编码 DNA、RNA 和蛋白质的序列，这些序列协调整个生物体的性能。机器进修的进步与全基因组的海量数据集相结合，可以实现生物根本模型，加速复杂份子相互作用的机械理解和生成设计。斯坦福大学（Stanford University）和 Arc Institute 的钻研职员开发了 Evo，这是一种基因组根本模型，可进行多模态和多尺度进修，能完成从份子到基因组范围的展望和生成…

编辑 | 白菜叶人工智能已经进入我们的日常生活。它可以是 ChatGPT，也可以是人工智能生成的比萨饼和啤酒广告。虽然我们不能相信人工智能是完美的，但事实证明，有些时候我们根本无法相信人工智能。冷泉港实验室（CSHL）西蒙斯定量生物学中心的助理教授 Peter Koo 发现，在分析 DNA 时，使用流行的计算工具来解释 AI 展望的科学家会收集到太多的「乐音」或额外信息。他找到了解决这个问题的要领…

编辑 | 雪松昼夜节律，如睡眠-觉醒周期，是大多数生物与生俱来的，对地球上的生命至关重要。昼夜时钟在 24 小时日夜周期中协调生物的各项生理变化，会间接影响我们人类的体能水平、健康程度、生存能力。同样，将新陈代谢与日出落日同步等情况也存在于动物中，正确的生物钟有助于安排开花。了解昼夜节律，于动物而言，有助于提高动物的生长和产量；于人类而言，则有可能揭示出治疗疾病的新途径。IBM欧洲钻研所与厄尔汉姆…