准确预测蛋白质「运动」?AlphaFold融合物理知识,南京大学团队蛋白构象运动新策略
编辑 | KX蛋白质如何进行构象运动,不仅是一个基本的生物物理问题,而且对于药物设计等实际应用也至关重要。尽管深度学习方法,比如 AlphaFold2 和 RoseTTAFold,可以高通量预测蛋白质的静态结构,但预测构象运动仍然是一个挑战。在此,南京大学、香港浸会大学(Hong Kong Baptist University)、中国科学院大学以及昌平实验室和莱斯大学合作,找到了一种新的方法来预测…- 26
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科学家用分子动力学和AlphaFold,揭示了转运卵白的未解布局
编辑 | 萝卜皮转运卵白改变其构象以携带其底物穿过细胞膜。构象动力学对于懂得运输功用至关主要。日本国立自然科学研讨院(National Institutes of Natural Sciences)和冈山大学(Okayama University)的合作团队研讨了草酸转运卵白(OxlT),这是一种来自产酸草酸杆菌的草酸:甲酸逆向转运卵白,对于避免肾结石形成具有主要意义。OxlT 的原子布局最近已在…- 8
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Nature | 通过序列聚类和 AlphaFold2 展望多种构象
编辑 | XAlphaFold2 (AF2) 通过准确展望卵白质的单一构造彻底改变了构造生物学。然而,卵白质的生物学功能通常取决于多种构象亚状况,而致病的点渐变往往会导致这些亚状况内的种群变化。来自布兰迪斯大学和霍华德·休斯医学研讨所(Brandeis University and Howard Hughes Medical Institute)、哈佛大学和剑桥大学的研讨团队,研讨证明通过序列相似…- 9
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