理论

编纂 | ScienceAI在基因组编纂领域，单碱基编纂器通过将可编程的DNA结合蛋白与碱基修饰酶融合，实现在不引起DNA双链断裂的情况下，对基因组中特定碱基进行精确修改。尽管依赖于胞嘧啶（C）碱基编纂器（CBE）或腺嘌呤（A）碱基编纂器（ABE）介导的脱氨反应，这些编纂器可能实现C到胸腺嘧啶（T）或A到鸟嘌呤（G）的渐变，但它们在引诱所有类型的点渐变，尤其是颠换渐变方面仍存在局限性。近期，西湖大…

编辑 | 萝卜皮各种复杂的调理利用给人工智能带来了巨大挑战：需要先进的推理、获取最新的医学知识以及对复杂的多模态数据的理解。Gemini 模型在多模态和长上下文推理方面具有强大的通用本领，为 AI 在医学领域利用提供了可能性。鉴于 Gemini 的核心优势，谷歌的研讨职员推出了 Med-Gemini，这是一个功能强大的多模态模型系列，专门用于医学，能够无缝运用网络搜寻，并且可以运用自定义编码器有效…

编辑 | X重新药物设想旨在从零开始生成具有一定化学和药理学特性的份子。近日，苏黎世联邦理工学院的化学家开发了一种新的计算机程序，可以根据蛋白质的三维表面快速、轻松地生成活性药物成分。研讨人员提出了一种使用鉴于相互作用组（interactome）的深度进修的计算办法，用于鉴于配体和布局的类药物份子生成。「这是药物发现的真正突破。」苏黎世联邦理工学院化学与使用生物科学系教授 Gisbert Schn…

编辑 | 萝卜皮空间转录组学的出现，彻底改变了构造内基因表白的研讨。然而，诠释空间点的生物特性仍然是一个挑战。为了解决这个问题，复旦大学的研讨人员引入了 Pianno，一个鉴于标志基因自动进行布局语义诠释的贝叶斯框架。Pianno 在精确诠释各种空间语义（从不同的解剖布局到复杂的肿瘤微环境）以及估计细胞典型分布（跨各种空间转录组学平台生成的数据）方面的卓越能力。研讨人员使用 Pianno 结合聚类…

在机器学习模型日益应用于开放世界场景中，如何有用辨别和处理漫衍外（Out-of-Distribution, OOD）数据成为一个重要研究领域[1]。漫衍外数据的存在可能导致模型过度自信和错误预测，这在安全关键应用（如自动驾驶和医疗诊断）中尤为危险。因此，发展一种有用的OOD检测机制，对于提高模型在实际应用中的安全性和可靠性至关重要。传统的OOD检测步骤主要集中在单一模态，特别是图象数据上，而忽视了…

作者 | Pengfei Zheng单位 | USTC, HKBU TMLR Group最近生成式AI的迅猛发展为文本到图像生成、视频生成等令人瞩目的领域注入了强大的动力，这些技术的核心在于聚集模型的应用。聚集模型首先通过定义一个不断加噪声的前向过程来将图片逐步变为高斯噪声，再通过逆向过程将高斯噪声逐步去噪变为清晰图片以得到采样。其中聚集常微分模型可以被用于生成的图片的插值，这在生成视频以及一些广…

LeCun 一如既往地不看好自返回 LLM。机械如何能像人类和动物一样高效地进修？机械如何进修天下运作方式并获得知识？机械如何进修推理和计划……当一系列问题被提出时，有人回答自返回 LLM 足以胜任。然而，知名 AI 学者、图灵奖得主 Yann LeCun 并不这么认为，他一直唱衰自返回 LLM。近日 LeCun 在哈佛大学的演讲内容深入探讨了这些问题，内容长达 95 页，可谓干货满满。LeCun…

编辑 | 萝卜皮近期，科学家在单个细胞内同时分解多组学模态的进展，使得细胞异质性和分子层次结构的钻研成为可能。然而，技术限制导致多模态数据的高噪声和高昂的成本。在这里，南开大学的钻研团队提出了 scButterfly，一种基于双对齐变分自动编码器和数据巩固方案的多功能单细胞跨模态翻译步骤。通过对多个数据集的全面实验，钻研职员证明 scButterfly 在保留细胞异质性、同时翻译各种背景的数据集和…

倾斜 AI-物理模型示意图。编辑 | X人工智能（AI）迅速发展，大模型正在重新定义我们明白和应对景象应战的方式。AI 模型已经席卷了大气迷信的各个领域。今年年初，中国迷信院大气物理研究所黄刚研究员团队将物理与 AI 融合，提升了数值形式的降水预报技巧。近日，黄刚团队联合中国迷信院大学、青岛海洋迷信与技术国家实验室、同济大学和首尔国立大学在《Advances in Atmospheric Scie…

AIxiv专栏是机器之心发布学术、技术内容的栏目。过去数年，机器之心AIxiv专栏接收报道了2000多篇内容，覆盖全球各大高校与企业的顶级实验室，有效促进了学术交流与传播。如果您有优秀的工作想要分享，欢迎投稿或者联系报道。投稿邮箱：[email protected]；[email protected]。

编辑 | 白菜叶与计算机迷信家 Ellie Pavlick 谈论她的工作——寻找大说话模型 (LLM) 中了解的证据——听起来可能像是在开玩笑。「hand-wavy」这个短语是她最喜欢的，如果她提到「意思」或「推理」，它通常会带有引号。作为一名在布朗大学和 Google DeepMind 钻研说话模型的计算机迷信家，她知道接受自然说话固有的模糊性是认真对待自然说话的唯一法子。「这是一门迷信学科——…

编辑 | 萝卜皮使用测序 (scATAC-seq) 技术对转座酶可及的染色质进行单细胞测定，可在单细胞分辨率下深入了解基因调控和表观遗传异质性，但由于数据的高维性和极度稀少性，scATAC-seq 的细胞诠释仍然具有挑战性。现有的细胞诠释办法大多集中在细胞峰矩阵上，而没有充分利用底层的基因组序列。在这里，中山大学与重庆大学的研究人员提出了一种办法 SANGO，通过在 scATAC 数据中的可及性峰…

AIxiv专栏是机器之心发布学术、技巧内容的栏目。过去数年，机器之心AIxiv专栏接收报道了2000多篇内容，覆盖全球各大高校与企业的顶级实验室，有效促进了学术交流与传播。如果您有优秀的工作想要分享，欢迎投稿或者联系报道。投稿邮箱：[email protected]；[email protected]。近期，大语言模型、文生图模型等大规模 AI 模型迅猛发展。在这种形…

招很多智能体来帮我干活。前不久，斯坦福大学教授吴恩达在演讲中提到了智能体的巨大后劲，这也引起了众多讨论。其中，吴恩达谈到基于 GPT-3.5 构建的智能体工作流在应用中展现比 GPT-4 要好。这表明，将目光局限于大模型不一定可取，智能体或许会比其所用的基础模型更加优秀。在软件开发领域，这些智能体展示了其独特的能力，能够高效合作，处理编程中的繁复问题，甚至进行代码自动生成。最新的技术动态显示，AI…

编辑 | X塑料垃圾严重影响生态平衡和人类健康。近年来，质料科学家一直在努力追寻可用于包装、产品制造的塑料全天然替代品。然而，创造满足一定机能的全天然替代品仍具挑战性。当前的方式仍然依赖于迭代优化实验。近日，马里兰大学帕克分校（University of Maryland，College Park）的研讨职员，提出了一个集成的工作流程，将呆板人技术和呆板进修相结合，减速环保塑料替代品的创造和安排。…

编辑 | 白菜叶几十年前，弦实践因其美丽的简单性而俘获了许多物理学家的心。该实践称，将一块空间放大得足够远，你将看不到大量的粒子或不稳定的量子场。只会有相同的能量股，振动、合并和分离。到 20 世纪 80 年代末，物理学家发现这些「弦」只能以几种方式跳动，这增加了物理学家追踪从跳舞的弦到我们天下的基本粒子的路径的诱人大概性。弦最深处的「隆隆声」会产生引力子，这是一种假设的粒子，被认为形成了时空的引…

编写 | 凯霞生成式 AI 可以对话、写诗、画图、做视频、作曲、写代码......那么，AI 可以改写人类基因组吗？现在，新的 AI 手艺正在为可编写 DNA 的微观生物机制绘制蓝图，这预示着未来科学家将以更高的精度和速度对抗疾病。近日，美国 AI 卵白质设计初创公司 Profluence 推出了 OpenCRISPRTM 计划，发布了世界上第一个开源的 AI 生成的基因编写器。Profluenc…

编辑 | 萝卜皮在不断发展的药物发明领域，保守方法由于作用低和资源需求高而面临重大寻衅。AI 药物公司 Model Medicines 和加州大学圣地亚哥分校的研究人员开发了 GALILEO AI 药物发明平台及其核心模型 ChemPrint，旨在提高药物发明的作用。为了解决命中率低和试探新化学空间困难的寻衅，该平台采用自适应份子嵌入和严格的模型训练环境来增强展望能力并导航未知的份子领域。在针对 …

引言如图 1所示，现有的三阶段 RGB-T 单方向追踪收集通常采用两个独立的特色提取分支，分别负责提取两个模态的特色。然而，相互独立的特色提取分支会导致两个模态在特色提取阶段缺乏有效的信息交互。因此，一旦收集完成离线训练，其仅能从每个模态图象中提取固定的特色，无法根据实际的模态状态动态调整，以提取更具针对性的动态特色。这一局限性制约了收集对多样的方向双模态外表，以及模态外表间动态对应关系的适应能力…

说话模型是否会规划将来 token？这篇论文给你答案。「别让 Yann LeCun 看见了。」Yann LeCun 表示太迟了，他已经看到了。今天要介绍的这篇 「LeCun 非要看」的论文探讨的问题是：Transformer 是急功近利的说话模型吗？当它在某个位子执行推理时，它会事先考虑后面的位子吗？这项研究得出的结论是：Transformer 有能力这样做，但在实践中不会这样做。  我们都知道，…

编辑 | ScienceAI蛋白质布局相比于序列往往被认为更加具有信息量，因为其直接决定了蛋白质的功能。而随着AlphaFold2带来的巨大突破，大量的猜测布局被发布出来供人研究应用。如何利用这些蛋白质布局来训练强大且通用的表征模型是一个值得研究的方向。西湖大学的研究人员利用Foldseek来处理蛋白质布局，将其编码成一维的离散token，并与传统的氨基酸举行结合，形成了布局感知词表（Struct…

作者 | 陈旭鹏 编辑 | ScienceAI由于神经系统的缺陷导致的失语会导致严重的生活障碍，它可能会限制人们的职业和社交生活。近年来，深度学习和脑机接口（BCI）技术的飞速发展为开发能够帮助失语者沟通的神经语音假肢提供了可行性。然而，神经旌旗灯号的语音解码面临挑战。近日，纽约大学 VideoLab 和 Flinker Lab 的钻研者开发了一个新型的可微分语音合成器，可以利用一个轻型的卷积神经…

编辑 | 紫罗药理学领域的化学空间高达 10^60，在广阔的化学空间中进行搜索，给药物安排带来了巨大的挑战。鉴于片断的药物发现一直是早期药物开发的有用范例。然而，该领域面临的一个挑战是，如何安排断开的感兴趣份子片断之间的接连子（linker），生成化学上合理的候选药物份子。在此，来自微软钻研院科学智能中心（AI4Science）、洛桑联邦理工学院、牛津大学和 MIT 的钻研团队，提出了一种用于份子…

编辑 | 萝卜皮随着抗癌钻研的不断深入，科学家们一直在寻找新的要领来提高治疗效果并减少副作用。小份子连系卵白的从头计划技术是解决这一问题的关键。然而，高亲和力连系和可调特异性，通常需要在计算计划后进行复杂的筛选和优化，这为钻研造成了重大阻碍。加州大学旧金山分校的钻研职员开发了一种名为 COMBS 的从头卵白质计划计算要领，并计划了能与新兴抗癌药物紧密连系的卵白质。实行考证表明，所计划的卵白质与药物…